在产权明晰的公司治理结构框架下，中国烟草总公司应在进一步明确责、权、利的基础上，加大管理整合力度，按现代企业制度要求进行规范管理，构筑科学合理的国有资产管理、运营、监督体系，形成产权清晰、权责明确、运行规范、管理科学的母子公司体制。在具体管理模式上，母公司对子公司应充分行使出资人权利，主要通过内部制度化管理，特别是通过产权管理、激励约束与监督管理机制，对子公司进行管理监控，从而保障母子公司在程序化、规范化、法制化的环境下良性运行，科学发展。

产权管理机制

    根据国务院有关文件，中国烟草总公司作为烟草行业国有资产的代表，依法对所属工商企业行使出资人权利。对于政府，它是资本经营者；对于企业，它是出资人代表。这样既解决了政企不分的难题，又可以保证出资人代表按市场规律进行资本运营。
    从这个意义上说，中国烟草总公司其实是一个国有资产控股公司，即出资人公司。国有资产控股公司作为公司制企业的一种特殊类型，专指以国有资本经营活动为目的而非以商品生产或服务经营活动为目的的公司形态。国有资产控股公司作为国有资本的出资人代表，负责授权范围内国有资本的运营，对控股企业履行出资人权利。它根据国家政策及市场情况进行资本运营，在企业内部实行人事管理、重大决策管理、收益管理三项事权管理，同时要进行战略管理、预算管理、运营监控管理三项辅助管理及产权事务管理，其目的在于控制被持有股权公司，通过控制性行为实现国有资产保值增值。
    中国烟草总公司作为国有独资控股公司，在烟草产业结构调整、提高企业运行效率以及引导经济发展方向等方面具有重要的作用：一是利用资本经营提高资源协同效应，提升资源利用效率；二是运用资本经营优化烟草产业结构，提升烟草行业竞争力；三是利用资本经营处理不良国有资产，盘活国有资产存量；四是利用资本经营进行国有经济增量投资，保证行业的持续竞争能力；五是推行现代企业制度，提高国有企业的经营治理水平。
    随着中国烟草总公司宏观决策、战略管理和资产经营能力的加强，作为出资人的总公司对子公司的产权管理主要体现在以下几个方面：一是管人方面，总公司通过任免子公司的管理层和董事会成员，达到战略管理和决策顺畅的目的；二是管资产方面，总公司决定资产转让的收益权和红利分配的收益权；三是管事方面，通过对重大项目的审批达到信息透明的目的，确保国有资产保值增值。

激励约束机制

    在中国烟草总公司与子公司之间的关系中，母公司对子公司经营绩效的评价是很重要的一个方面，而其中的关键是建立一套基于经营者业绩的有效激励机制。
    （一）建立评价机制
    企业的盈利能力、资产运营能力、偿债能力、后续发展能力是企业生存发展的四个最基本方面。中国烟草总公司需要根据这四方面内容，建立烟草工业企业的综合评价指标体系。第一个层次是基本指标，是指影响企业最基本的发展因素的一些指标。第二个层次是修正指标，是指就影响对企业科学评价的一些特殊因素制定的指标。第三个层次是评议指标。企业发展是个复杂的过程，有很多东西不能量化，还需要进行人为判断、评议，以对定量分析进行校正。
    烟草工业企业需要建立一套科学、规范、统一的行业评价标准，实现企业考核由过去单纯的纵向对比转为纵向对比与横向对比相结合，确保评价结果的客观公正。需要根据烟草工业的特殊性，开发烟草工业企业绩效评价计算机软件。输入企业的财务资料，与分档的标准值进行对比，就能得出较为准确的结论。
    烟草工业企业评价体系的建立，要发挥这样的作用：第一，有利于出资人对企业经营者科学的考核、评价和奖励。第二，能够正确评价经营者的业绩。第三，要通过总公司对子公司科学的考核和评价，使经营者的经营与其收入分配等有机结合起来。另外，烟草企业绩效科学评价有利于促进烟草行业企业人事制度改革、收入分配制度改革、资本与财务管理改革。
    （二）完善激励机制
    由于是国有独资公司，且资本结构不对外，没有社会资本参与，因此烟草企业经营者的激励不适用股票激励和股票期权激励等市场化激励手段。从现实出发，年薪制可能是烟草行业较为有效的激励机制。
    烟草行业