乡镇实行会计集中核算之后，规范了乡镇财务管理程序，有效地统管了乡级财政资金，有力地支持了乡镇经济的迅速发展，但也存在着一些不容忽视的问题，主要表现在：

    一、对政策理解的偏差，对财务管理这一职能的认识不足。乡镇行政事业单位理财意识淡薄，往往只重支出轻效益，重收入轻预算，重购置轻保管，而且把会计核算和财务管理等同起来，认为会计核算和财务管理是同一回事。这种现象在行政事业单位普遍存在，并且由来已久。在单位会计核算工作更加突出，很多单位认为既然已经把会计核算工作都已交由核算中心处理，单位就不存在着其他财务管理的问题，把财务管理简单地理解是“签字、审批”而已。而实际上单位财务管理的范围非常广泛，大至单位预算编制、资金投向、支出决策、财务审批，小至日常现金管理、实物台账登记等都是财务管理的内容。

    二、单位财务制度建设欠缺。在各行政事业单位财务纳入之初，要求各单位向中心报送单位内部财务管理制度。但很少有单位能提供一份比较健全的内部财务管理制度，有些在内容上非常简单，有些是很多年前制定的而内容上早已不再适用，有些单位则什么都没有。由此可见，财务管理方面的制度建设在很多单位都是单位各项制度建设中的弱项。根据要求，各单位必须依照《会计法》、统一财务制度以及地方财经制度，结合单位实际，制定单位内部的财务管理制度。由于目前各地核算中心在办理单位业务是基本上没有严格统一的开支标准，单位在资金的使用上有着很大的随意性，中心工作人员也失去了对单位收支进行最后把关的依据，协助单位理财就成为一句空话。

    三、相互之间缺乏适当的配合，并在配合的方式上也存在着一定的缺陷。进行会计集中核算后，会计职能和财务管理职能基本上由中心和单位分担，而财务管理必须建立在会计核算的数据之上，如果相互之间不进行必要的沟通和经常联系，仅凭每月一次的会计报表很难把一个单位的财务工作做好。其次，各种资金的性质往往有所不同，就要和单位及时沟通，了解情况，才能进行准确核算。

    四、有些单位财务主办的业务水平不高，与财务主办的要求还有一定的差距。尤其是有关会计电算化的知识急需学习和提高，一般单位进中心之后就撤销了原来的会计，由出纳来担任财务主办工作，更有些单位本来就是会计代理的，单位内部没有财务人员，只好临时调用非专业人员担任报帐工作，致使单位理财水平更加下滑。一些必要的备查账簿如财产实物账、备用金使用日记账等都没有建立。随着计算机的普遍应用，原来的手工记账将逐渐被计算机所代替。这样不仅要求中心核算人员要同时具备较高水平的会计知识、计算机基础知识和熟练运用所采用的财务软件，同时也要求单位主办和分管财务工作的领导也要具备一定的会计电算化基础知识。

    五、财政资金体外循环的现象依然存在。乡镇内部各站所，都有不同程度的收入来源。收入往往不进中心单位账，各站所另外设有