随着市场经济的发展，特别是我国加入世贸后，工会在维护职工合法权益、协调稳定劳动关系方面的作用日益凸显。同样，在教育系统，教育工会的作用也随着教育体制改革尤其是教师人事制度改革的不断深入而越来越显示出重要性。但是，从目前各地教育工会的运行情况来看，教育工会要真正把职责履行到位，尚有不少难点亟待克服。难点主要体现在三个方面：
    其一，工会的组织建设仍显薄弱和滞后。一是机构编制没有权威文件认定，造成相当部分基层工会没有人员编制，一些教育工会干部长期是编外人员，而县（市）级及其以下的教育工会组织机构更是难以得到落实。二是不少工会干部政治待遇没有兑现，经济待遇遭歧视。三是干部队伍不稳定，调整、调动随意。四是工会干部担子重，不少县（市、区）是单兵作战，有的甚至没有一个专职工会干部。
    其二，教育工会经费严重短缺，“无米之炊”直接制约了工作开展。造成经费短缺的原因，一是非公有制经济在国民经济中所占比重不断增大，但新经济组织的工会组建、尤其是经费缴却难度较大，以致地方总工会自身活动经费困难，没能按全总有关文件回拨市、县教育工会8~10%；二是一些地方由于财政吃紧，有时连机关班干部的工资都无法及时足额发放，拨交工会经费更成为“侈谈”；三是一些地方在机构改革中由于对“收支两条线”的误解，取消了市、县教育工会的户头，使教育工会经费更无着落。
    其三，教育工会作风难以适应实际工作的需要。尽管转变工会作风的口号已喊了很多年，但不少工会仍没有摆脱行政化、机关化的倾向，有的热衷于搞无益的检查评比、无效的系列活动；有的呆在机关津津乐施“衙门作风”，不愿深入基层、深入教职工群众，不愿做艰苦细致的调查研究，不愿为教职工排忧解难，也不愿做教职工的思想政治工作。
   显然，教育工会要担负起时代赋予的职责，必须疑攻克这些“难点”。这些难点的解决，要靠工会自身的努力，更需要有关方面