猫杯状病毒分离株VP1基因序列与致病性分析
刘 健,白艺兰,李 鑫,桂亚萍,鞠厚斌,龚国华,夏炉明,陈伟锋,朱晓英,常晓静,李增强,唐聪圣,王 建,赵洪进
(上海市动物疫病预防控制中心,上海 201103)
猫杯状病毒(feline calicivirus,fcv)属于杯状病毒科、水疱疹病毒属,是一种引起猫科动物口腔与上呼吸道疾病的重要病原。fcv呈世界性分布,在猫科动物中具有高度传染性,猫及老虎、猎豹等野生猫科动物均易感。fcv主要临床症状表现为鼻炎、结膜炎、急性口腔溃、肺炎、慢性胃炎和跛行等。近年来,由于fcv高度的变异性产生的强毒株可引起严重、急性、致死性全身性疾病,死亡率高达50%,症状可表现为溃疡性皮炎、急性关节炎、肠炎、流产以及跛行等全身感染,对猫及猫科动物造成严重威胁。
fcv全基因组由3个开放性阅读框(open reading ,orf)组成,其中,orf2基因编码结构蛋白1,按功能域orf2又可划分为a、b、c、d、e和f 6个区。c和e区变异性较大,特别是e区包含鉴别vs-fcv的特征性氨基酸突变位点,变异最为明显,也是早期疫苗免疫失败的重要原因。为了进一步了解fcv在上海地区流行状况及其遗传变异和演化方向,本研究从2021年1月—3月,从上海地区上呼吸道症状猫的病料中分离鉴定得到13株fcv,对其1基因进行遗传演化分析,丰富了国内fcv分离株的基础数据,也为该病毒强毒株的筛选和疫苗研究提供参考依据。
1 材料与方法1.1 样品采集及处理从上海市中心城区宠物医院收集了17份具有上呼吸道症状患猫的眼结膜、口咽和鼻黏膜拭子样品,记录患猫的年龄、猫三联灭活疫苗免疫情况、主要临床症状(表1)。将采集的拭子加2 ml pbs缓冲液浸泡后,用0.22 μm微孔滤膜过滤,-20 ℃保存备用。
表1 临床样品采集的详细信息table 1 details of the clinical samples
1.2 细胞和主要试剂f81细胞(猫肾传代细胞)由上海市动物疫病预防控制中心兽医实验室保存。猫三联灭活疫苗(猫鼻气管炎、嵌杯病毒病、泛白细胞减少症)(批号:d286389a)购自硕腾(上海)企业管理有限公司;dmem细胞培养液(批号:2126865)、0.25%浓度胰酶消化液(批号:2042303)均购自gibco公司;胎牛血清(批号:2418)购自sigma公司;核酸提取试剂盒(批号:mdii14-01)购自magen公司;prime rt-pcr kit(批号:aj62323a)、la pcrkit ver.2.1(批号:ak5301)、prime one step rt-pcr kit ver.2(dye plus)(批号:ake0559a)购自宝生物工程(大连)公司;猫疱疹病毒1型荧光pcr检测试剂盒(批号:fhv20210504)、猫细小病毒荧光pcr检测试剂盒(批号:fpv20210604)购自上海尔创生物科技有限公司。
1.3 病料的rt-pcr鉴定吸取50 μl上述处理的样品,猫三联灭活疫苗作阳性对照,阴性拭子作阴性对照,提取总rna,依据参照文献[6]合成引物:上游引物fcv-jcf:5′-gcctcaaacattaggagtgc-3′;下游引物fcv-jcr:5′-ccctggggttaggcgcag-3′,扩增片段为420 bp,引物由上海桑尼生物科技有限公司合成。按照文献[6]的方法进行rt-pcr扩增,1%琼脂糖凝胶电泳分析,将出现预期目的片段的rt-pcr产物送上海桑尼生物科技有限公司进行测序,测序结果用ncbi中的blast工具进行比对分析,确认是否为fcv基因序列。同时将fcv阳性的样本接种f81细胞,进行病毒的分离培养。
1.4 病毒分离f81细胞常规消化传代,待长成单层且贴壁率达到90%时,将细胞按照1∶3的比例消化传代,同时将上述病料同步接种到细胞中,37 ℃,5% co浓度培养箱中培养,每6 h观察细胞病变1次,70%细胞出现细胞病变、圆缩和脱落时,将培养液冻融3次,收集细胞上清。
1.5 病毒鉴定1.5.1 fcv1基因的扩增 依据参考文献[4]合成fcv1基因全长扩增引物,fcv-vp1上游引物:5′-atgtgctcaacctgcgc-3′;fcv-vp1下游引物:5′-tcataatttagtcattgagctcct-3′。fcv1基因序列全长2 007~2 010 bp,引物由上海桑尼生物科技有限公司合成。体系总体积为50 μl:prime rt-pcr kit buffer 25 μl,enzyme mix 2 μl,上、下游引物(浓度均为10 μmol·l)各1 μl,rna模板1 μl,双蒸水补至50 μl。反应条件:50 ℃反转录30 min;94 ℃预变性2 min;94 ℃变性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,30个循环;72 ℃延伸10 min;4 ℃ 保存。取5 μl rt-pcr扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳鉴定,阳性rt-pcr产物送上海桑尼生物科技有限公司进行测序。测序结果用ncbi中的blast工具进行比对分析,确认是否为fcv的1基因序列。
1.5.2 形态学鉴定 将分离病毒株第3代培养物接种f81细胞,待70%细胞出现cpe后反复冻融3次收毒,将收获的细胞液冻融3次后,10 000 r·min离心1 h,除去细胞碎片,随后上清液与终浓度为10%的聚乙二醇8000(peg8000)混合过夜。在4 ℃下12 000 r·min离心2 h后,用tris缓冲盐溶液(tbs)重悬,经2%磷钨酸负染后进行透射电镜观察。
1.5.3 外源病毒检测 对13株分离株进行猫疱疹病毒1型(fhv-1)和猫细小病毒(fpv)两种外源病毒检测。根据猫疱疹病毒1型荧光pcr检测试剂盒和猫细小病毒荧光pcr检测试剂盒要求,对分离病毒株第3代培养物进行fhv-1和fpv荧光pcr检测。
1.6 构建遗传演化树分别参照国内外fcv强毒株、经典株和疫苗株1基因序列(表2),利用mega 6.0和dnastar v7.1软件构建fcv1基因遗传演化分析树,并分析其序列特征。
表2 fcv vp1参考序列table 2 reference strains of fcv vp1 gene
1.7 分离致病性试验1.7.1 分离株有限稀释纯化 将fcv-sh202101和fcv-sh202113分离病毒株第3代培养物用细胞培养液进行10倍的倍比稀释,共稀释11个稀释度,将稀释液与消化好的细胞悬液按照体积比1∶3加入至6孔板中,第12孔加细胞悬液作阴性对照,每孔体积为2 ml。37 ℃,5% co浓度培养箱中培养,每6 h观察细胞病变1次。待70%细胞出现细胞病变、圆缩和脱落时,收获出现细胞病变的最大稀释度孔的上清进行二次有限稀释纯化,共稀释纯化6次,测定纯化后病毒液的tcid,-80 ℃保存备用。
1.7.2 攻毒试验 将6只健康中华田园猫(3只2~3月龄幼猫,3只2岁左右成年猫,均未免疫过猫三联灭活疫苗)分为a组、b组和对照组,每组均为2只,包括1只幼猫和1只成年猫。a和b 组猫均采用滴鼻和口服方式分别接种10tcid·ml的fcv-sh202101和10tcid·ml的fcv-sh202113分离株病毒液,接种剂量为滴鼻和口服各1 ml·只;对照组猫接种相同剂量的dmem细胞培养液。不同感染组隔离饲养,自由采食、饮水,每日监测猫的临床症状和死亡情况,同时采集眼、口、鼻拭子用于排毒情况的检测。
2 结 果2.1 病料的rt-pcr检测17份病料经fcv rt-pcr扩增,其中,编号为bd20210104-2~bd20210104-8、bd20210112-1、bd20210127-1、bd20210804-1、bd20210804-3~bd20210804-5的13份样品扩增产物经凝胶电泳检测显示,在420 bp左右出现与预期目的产物大小一致的目的条带,部分病料样品的扩增结果见图1。
m. dl2000 dna相对分子质量标准;1~4. rt-pcr阳性病料样本;5~8. rt-pcr阴性病料样本;9. 阳性对照;10. 阴性对照m. dl2000 dna marker; 1-4. rt-pcr positive samples; 5-8. rt-pcr negative samples; 9. positive control; 10. negative control图1 部分病料fcv rt-pcr检测结果fig.1 fcv rt-pcr detecting results of part samples
将13份样品的rt-pcr产物进行测序,测序结果在ncbi中进行blast比对分析,确认13个序列均为fcv的基因序列,表明13份样品均为fcv阳性。
2.2 阳性病料接种f81细胞13份fcv阳性病料接种f81细胞,盲传3代,第3代细胞培养物接种f81细胞24 h,均产生cpe,细胞出现圆缩、拉丝、聚集现象,然后脱落、漂浮在细胞维持液中(图2)。
a.接种bd20210104-2第3代细胞培养物的f81细胞;b.阴性对照a. f81cells inoculated the 3rd generation cell culture of bd20210104-2; b. negative control图2 接种bd20210104-2第3代细胞培养物24 h后f81细胞病变结果fig.2 cpe of the 3rd generation cell culture of bd20210104-2 in f81 cells at 24 h
2.3 fcv vp1基因的扩增将13份病毒上清液提取rna,进行fcv1 rt-pcr扩增,产物经琼脂糖凝胶电泳检测后得到约2 000 bp大小的条带,与预期2 007 bp大小一致(图3)。测序结果拼接后,得到13株fcv的1全基因序列,将13株病毒1基因序列在ncbi中进行blast比对分析,确认13株序列均为fcv的1基因序列,表明13株分离株为fcv,分别命名为fcv-sh202101~fcv-sh202113。
m. dl2000 dna相对分子质量标准;1~13. fcv vp1 rt- pcr阳性产物m. dl2000 dna marker; 1-13. fcv vp1 rt- pcr positive products图3 fcv vp1 rt-pcr结果fig.3 fcv vp1 rt-pcr detecting results
2.4 形态学观察fcv-sh202101株f81细胞第4代培养物经电镜负染观察可见无囊膜,呈圆形、椭圆形等形态,直径30~40 nm的病毒粒子(图4),与杯状病毒粒子形态特征相符,表明分离株病毒为fcv。
图4 fcv-sh202101病毒粒子电镜图fig.4 electron microscopy image of isolated fcv-sh202101 strain
2.5 分离株外源病毒检测对13株fcv分离株进行fhv-1和fpv两种外源病毒荧光pcr检测,结果均为阴性。
2.6 fcv vp1同源性及遗传演化分析2.6.1 分离株与国内外参考株1基因同源性及遗传演化分析 将13株fcv分离株与国内外参考株1基因进行同源性分析。结果显示,13株上海分离株之间的核苷酸序列相似性为74.3%~99.8%,其中,fcv-sh202103株与fcv-sh202104株相似性最高,为99.8%;fcv-sh202108株与 fcv-sh202111株相似性最低,为74.3%。与国内外强毒株相似性为73.8%~82.9%,其中,fcv-sh202113株与fcv-5株相似性最高,为82.9%;与国内外经典株相似性为73.4%~80.1%,氨基酸序列分析显示,fcv-sh202102株与fcv-yh-16株的相似性高达91.9%,fcv-sh202108株与fb-nj-13株的相似性最低,为82.1%;与疫苗株相似性为73.2%~79.8%,氨基酸相似性fcv-sh202103株与f4株高达89.4%,fcv-sh202102株与f4株最低,为82.7%。
遗传演化树分析显示,13株分离株分布于3个分支,fcv-sh202108株与上海分离株sh/2014遗传关系较近,fcv-sh202103、fcv-sh202104和fcv-sh202112遗传关系较近,与国外参考株和疫苗株处于同一分支;fcv-sh202113株与强毒株fcv-5遗传关系较近,处于同一分支;其余毒株与国内参考株处于同一分支,且fcv-sh202101、fcv-sh202102、fcv-sh202106、fcv-sh202107、fcv-sh202109和fcv-sh202110遗传关系较近(图5)。
▲表示分离毒株▲stands for isolated strain图5 分离株与参考株vp1基因序列遗传演化树fig.5 maximum-likelihood tree d on vp1 gene of isolated strains and reference strains
2.6.2 vs-fcv特征性氨基酸分析 以部分e区(426—461 aa)分析的具有vs-fcv突变特征氨基酸位点为依据,确定430、438、443、448、452、455和458为vs-fcv特征性氨基酸位点(图6)。结果表明5株分离株与vs-fcv有6个位点吻合,7株分离株有5个位点吻合,1株分离株有4个位点吻合(表3)。
表3 fcv vp1蛋白部分e区强毒株特征性氨基酸位点分析table 3 vs-fcv characteristic amino acid sites analysis of partical e region in vp1 protein
图6 vp1蛋白部分e区的氨基酸比较图fig.6 comparison of amino acid sequences of partical e region in vp1 protein
2.7 分离株致病性试验2.7.1 病毒液tcid的测定 测定fcv-sh202101株和fcv-sh202113株细胞半数感染量分别为10和10tcid·ml。
2.7.2 感染猫的临床症状 fcv202101株和fcv2021131株感染中华田园猫后,48 h内幼猫陆续出现杯状病毒上呼吸道症状,如眼屎增多、气喘、咳嗽等,体温最高升至39.5 ℃,5 d后幼猫均濒临死亡。a组成年猫1周后出现眼屎增多现象,11 d后猫濒临死亡;b组成年猫1周后无明显的临床症状,2周后出现临床症状,精神沉郁、不食、发烧、眼屎大量增多,18 d后死亡。
2.7.3 感染猫的排毒情况 每日采集不同感染组猫的眼、鼻、口拭子,利用rt-pcr方法检测其排毒情况(表4),结果表明,fcv202101株和fcv2021131株感染猫3 d后,可持续从眼、鼻、口拭子中检测到fcv。
表4 猫感染fcv后排毒情况table 4 virus shedding of cats after fcv infection
2.7.4 感染猫的发病与死亡情况 fcv202015株和fcv202031株感染猫后,均可导致试验猫的发病和死亡(图7),对幼猫具有较强的致死性,且病程短、发病急,对成年猫也具有致死性,但病程长短不一。
图7 试验组猫感染fcv后存活率fig.7 survival rate of cats after fcv infection
3 讨 论近年来,随着国民生活水平的逐步提高,上海市猫宠呈逐年上升趋势,已逐渐成为宠物市场的主流。在猫的传染病病例中,猫杯状病毒感染病例占1/3以上。本研究对17例呼吸道症状的猫病例进行猫杯状病毒的分离,经过细胞病变、1测序、病毒电镜观察,13株分离株都鉴定为fcv,阳性率达到76.47%,与周孟云等在杭州宠物猫中调查的结果基本一致,表明上海市具有呼吸道症状的宠物猫杯状病毒感染比较普遍。
由于fcv的rna聚合酶缺乏校正功能,导致其基因组频繁变异,当出现vs-fcv时,就可能导致疫苗失去保护力。美国的pedersen等首次报道在1998年采集的样品中发现了vs-fcv,2003年英国及2009年法国也暴发过疫苗免疫的成年猫感染vs-fcv,2013年velasco等报道了西班牙暴发vs-fcv,2018年郭慧敏等首次报道了vs-fcv在我国流行。上海地区13株fcv分离株之间的1核苷酸序列相似性为74.3%~99.8%,与国内外参考株的核苷酸序列相似性为73.2%~80.1%,氨基酸相似性82.7%~91.9%,其中与疫苗株的核苷酸相似性只有73.2%~79.8%,氨基酸的相似性为82.7%~89.4%,分离株1核苷酸序列和氨基酸序列相似性均不高,符合fcv易突变的特征。遗传演化树显示,2株分离株与强毒株处于同一分支,8株分离株与国内经典株处于同一分支,3株分离株与国外经典株亲缘关系较近,研究表明,上海市主要流行株可能来自国内北方地区,少数毒株来自国外,与刘春国等研究结果一致,表明上海市fcv起源于不同祖先,其遗传存在生物多样性。虽然smith等认为fcv-f9疫苗株仍然能够预防fcv的感染,但是遗传演化树显示,本市分离株与疫苗株遗传关系较远,可能是当前疫苗对猫的免疫效果不佳的主要原因。
分离株与国内强毒株sh2014(shanghai)株相似性为74.7%~77.4%,与国外强毒株相似性为73.8%~82.9%。分离株与强毒株同源性虽然不一致,但是仅从核苷酸和氨基酸序列同源性上并不能将经典fcv与vs-fcv株区分出来。遗传演化树显示,fcv-sh202108株和fcv-sh202113株与强毒株遗传关系较近,其中,fcv-sh202113株与fcv-5处于同一分支,fcv-sh202108株虽然与经典株ls015处于同一分支,但同时与强毒株fcv-george walder、fcv-jengo、fcv-kaos、utcvm-h1、sh2014(shanghai)、utcvm-h2遗传关系较近,表明fcv-sh202108和fcv-sh202113株具有强毒株的可能。fcv1衣壳蛋白可分为a、b、c、d、e和f等6个区,其中e为超变区,有研究发现vs-fcv具有特征性氨基酸位点,foley等对e区具有vs-fcv突变特征的氨基酸位点进行比较分析发现,430位、438位、443位、448位、452位、455位和458位aa可能与其致病性相关。对e区中7个可能的强毒株特征性氨基酸位点分析,发现fcv-sh202101、fcv-sh202102、fcv-sh202107、fcv-sh202109和fcv-sh202110株有6个氨基酸位点与已公开vs-fcv株吻合,而已报道的广西株只有一个吻合位点。因此fcv-sh202101、fcv-sh202102、fcv-sh202107、fcv-sh202109和fcv-sh202110株也具有强毒株的可能。
从采样宿主临床症状、1进化树和vs-fcv特征性氨基酸位点进行分析,选择fcv-sh202101株和fcv-sh202113株进行动物感染试验,研究表明,fcv-sh202101株和fcv-sh202113株感染中华田园猫后均可导致发病和死亡,病毒的潜伏期为1~2 d,接种后第3天即可检测出排毒,不同年龄段猫的病程不一致,幼猫5 d后可导致死亡,成年猫病程可持续11~18 d,说明fcv-sh202101株和fcv-sh202113株可能为vs-fcv中国分离株,但vs-fcv的确诊还需要进一步研究病毒复制病例各脏器fcv的分布和滴度、病理变化以及可否造成感染猫的群体性发病与死亡等。
4 结 论本研究从临床呼吸道症状猫分离到13株能在f81上形成cpe的病毒,经测序和电镜观察鉴定为fcv,1序列分析表明上海地区fcv流行株主要来自国内北方地区,少数毒株来自国外地区,动物感染试验表明2株fcv具有vs-fcv致病性特征,为vs-fcv毒株的筛选提供了有力的证据,也为fcv疫苗的研究提供了技术支持。
猫杯状病毒分离株VP1基因序列与致病性分析
本文2022-11-02 19:43:50发表“毕业论文”栏目。
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