目前，各地农村合作银行刚刚才成立，如何加强内部审计建设，对于农村合作银行完善内控机制、防范金融风险显得尤为重要。但目前农村合作银行内部审计效率低下的现状，仍困扰着银行内部的内控制度建设。
        原　　因
        1.内部审计力量薄弱，人员结构不合理。一是审计人员不足，达不到银监部门规定的要求，从现状看一般缺编三分之一人员。以我行为例，2005年12月末，存款规模达到203亿元，全行员工1209人，共有31家支行，66家分理处，18家储蓄所，102家信用服务站，只配备了5名审计人员。二是审计人员素质和知识结构与合作银行经营业务的多元化发展不相适应，仍延用着农村信用社时期的人力，仍以传统账务财务、会计结算等方面的业务人才为主，掌握新业务和新技术的人才严重缺乏。三是对审计人员培训力度不足，且培训方式较为单一。
        2.激励考核机制不到位，影响审计效率。审计工作的业绩考核不独立，目前仍然实行内部审计部门业绩由被审计对象进行评分考核，使得内部审计难以超然和公正，影响审计工作的主动性和公正性。
       3.内部审计缺乏规范化的质量衡量和评价标准。因为各地农村合作银行的内控制度均为自订，没有全国性一整套的合作银行规章制度，因此更谈不上审计制度的规范化、程序化和标准化，缺乏审计工作质量的衡量和评价标准。在此状况下，审计人员大都按习惯做法或各自经验进行工作，审计流程不完善，审计检查范围随意性大，对同一业务检查过程、内容和标准不统一。
       4.内部审