一是转换经营机制
　　 这次改革，国家给予了农信社包括资金支持、财政补贴、税收优惠等多项扶持政策，有效地减轻了历史包袱，资产质量、财务状况有了明显好转。但是，改革的目的并不是单纯的“输血”，而是培育和恢复“造血”功能。即在给予农信社政策扶持的同时，激励和引导其切实转换经营管理机制，逐步走上长期、可持续发展的良性轨道。目前，对于已经落实了国家扶持政策的大多数农信社来说，必须切实将工作重点转到转换经营机制，完善法人治理方面，否则，改革扶持政策所产生的积极效应将付诸东流，改革就可能前功尽弃。因此，巩固改革成果、促进发展的关键在于切实转换经营机制，完善法人治理结构。
　　转换经营机制，首先是制定和完善内部管理制度，如贷款、投资管理责任制，规范业务工作流程和岗位监督，推行严格的问责制，加强内部稽核审计，推行全员竞争上岗用工制度，等等。在这些制度的基础上，通过建立一种动态的激励、约束、奖惩的机制，使这些制度得到贯彻和落实，并最终形成一种固化的良性的运作方式，促进农信社业务快速发展和经营效益的根本改善。
　　完善法人治理结构，重在建立健全不同产权模式和组织形式下的法人治理结构，明确划分各级联社、农信社社员代表大会、理事会、监事会以及理事长、主任、监事长的职责，完善议事制度和决策程序，增加“三会” 透明度，形成权责统一、运转协调、有效制衡、行为规范的治理形式和组织制度。尤其要强化社员（股东）的股权意识和监事会的监督职能，形成对高级管理层的制衡，弱化农信社内部人控制行为。
2、实施有效监管
　　 一是坚持分类监管的原则。对农村商业银行、农村合作银