近年来，各级国税稽查部门坚持以打击偷、逃、骗、抗等涉税违法为中心，精心组织和实施各类纳税检查，充分发挥以查促收、以查促管和以查促查的职能作用，为打击涉税违法犯罪活动、维护正常的税收秩序和圆满完成各项国税工作任务作出了积极贡献。但在稽查实践中仍存在一些问题与不足，需要引起重视和不断改进。
    一、问题与不足
    （一）稽查选案存在片面性
    一是案源信息来源少，渠道不畅。税务稽查需要通过获取大量的内、外部信息确定案源，而当前稽查选案的基础信息主要来源于税收征管信息系统，征管环节其他部门以及地税、银行、司法机关等协税护税单位转来的涉税违法信息较少，社会公共信息获取渠道也不畅快，一定程度上造成盲目稽查选案；二是选案方法欠科学，缺乏监督。当前税务稽查选案主要以人工选案为主，缺乏科学、严密的选案指标，加之案源信息来源有限和缺乏监督，较易发生误选、漏选、选人情案或重复选案。
    （二）检查实施存在局限性
    一是个别稽查人员责任心、事业心不强，工作热情不高，人情意识太强，随意执法的现象尚未杜绝；二是证据收集及审查标准欠统一，稽查人员往往凭个人理解及判断能力收集和审查稽查证据，证据的收集及审查存在较大的主观因素和随意性，导致所取证据缺乏关联性、充分性和有效性，证据收集形式和内容不规范，增加了税务执法的风险性；三是外部干扰较大，主要是地方党政干预，经常使稽查人员陷入两难境地，稽查工作处于被动局面，不仅弱化了稽查执法的力度，而且严重挫伤了稽查人员的工作积极性。
    （三）审理定案缺乏规范性
    一是自由裁量欠规范。税务稽查部门对涉税违法行为进行处罚时往往采取“一刀切”的办法，不区分情节轻重，均处以相同的处罚，一方面造成无法震慑应处以较重处罚的违法行为，另一方面造成对情节轻微的违法行为处罚偏重；二是重大案件标准偏高。现行税务稽查案件审理实行三级审理，其中重大案件必须报送国税局重大案件审理委员会审理,由于各地经济发展不匀衡，查处税案情况不一，经济欠发达地区每年查补税款100万元以上的案件较少，但为了达到重大案件报送比例，只好将定性偷税的小案件上报，既加大了市局法规科的工作量，又增大了纳税人负担。
    （四）案件执行缺乏时效性
    主要表现在招商引资企业、重点保护企业执行难，走逃、困难企业执行难，处罚较重的纳税人执行难，加之税务强制执行措施力度有限，部分案件往往难以执行到位，影响了稽查效率。
    （五）队伍建设缺乏延续性
    随着经济社会的日益发展，对税务稽查人员的素质要求越来越高，由于缺乏后续教育与培训，部分稽查人员对会计、税务、法律和计算机等方面的知识较为欠缺，难以适应新形势下税务稽查工作需要，导致办案往往停留在就帐查帐层面上，无法将案件查深查透，案件质量也就不高。
    （六）监督制约存在随意性
    当前稽查“四分离”相互监督制约主要是通过对相互间传递的资料进行